Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Бывший главный тренер "Химок" Андрей Талалаев рассказал о том, что полузащитник московского "Локомотива" Алексей Батраков мог заиграть в подмосковском коллективе.
По информации СМИ, защитник подмосковных "Химок" Георгия Джикия с апреля 2021 года по ноябрь 2024 года за нарушения ПДД был оштрафован на общую сумму 2 млн 32 тыс. рублей.