Основан 23 июля 1922 года. Один из старейших футбольных клубов России, ведущий свою историю с момента основания «Казанки» при Московско-Казанской железной дороге, затем неоднократно менявший своё название
Бывший главный тренер "Томи" Валерий Непомнящий высказал мнение о возможном переходе полузащитника "Локомотива" Алексея Батракова во французский "Монако".